Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms