Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms