Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR1P43307 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR1P43307 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSR1P43307 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms