Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA3P32297 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms