Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms