Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms