Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms