Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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