Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TNNI3P19429 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TNNI3P19429 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TNNI3P19429 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TNNI3P19429 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TNNI3P19429 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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