Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GP1BBP13224 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms