Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH1P12830 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH1P12830 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH1P12830 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH1P12830 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms