Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT3P12035 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms