Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DMDP11532 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DMDP11532 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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