Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 APCDD1L-AS1-205ENST00000439558 648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC009121.1-201ENST00000574681 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LYZL6-201ENST00000615905 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms