Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms