Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LTAP01374 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LTAP01374 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms