Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4FO95754 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms