Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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