Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms