Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms