Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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