Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDIL3O43854 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms