Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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