Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCAO15360 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCAO15360 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms