Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms