Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PODXLO00592 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PODXLO00592 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PODXLO00592 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PODXLO00592 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PODXLO00592 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PODXLO00592 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PODXLO00592 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.6 ms