Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms