Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA2O00451 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms