Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms