Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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