Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CCDC179H3BU77 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms