Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms