Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms