Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms