Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms