Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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