Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms