Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms