Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms