Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGAP28Q9P2N2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms