Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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