Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GIN1Q9NXP7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GIN1Q9NXP7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GIN1Q9NXP7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GIN1Q9NXP7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GIN1Q9NXP7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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