Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms