Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms