Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms