Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMMDC1Q9NPL8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms