Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXF3Q9H4D5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms