Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms