Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1421.8 ms