Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms